MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017796	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	386858761
2	NC_017796	A	6	6	1252	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	386858761
3	NC_017796	TTAT	2	8	1258	1265	25 %	75 %	0 %	0 %	386858761
4	NC_017796	TA	3	6	1271	1276	50 %	50 %	0 %	0 %	386858761
5	NC_017796	TA	3	6	1292	1297	50 %	50 %	0 %	0 %	386858761
6	NC_017796	TA	4	8	1456	1463	50 %	50 %	0 %	0 %	386858762
7	NC_017796	TC	3	6	1485	1490	0 %	50 %	0 %	50 %	386858762
8	NC_017796	GAGG	2	8	1501	1508	25 %	0 %	75 %	0 %	386858762
9	NC_017796	TGTT	2	8	1514	1521	0 %	75 %	25 %	0 %	386858762
10	NC_017796	ATG	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858762
11	NC_017796	TGAT	2	8	1535	1542	25 %	50 %	25 %	0 %	386858762
12	NC_017796	AT	3	6	1598	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	386858762
13	NC_017796	TAG	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858763
14	NC_017796	AGT	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858763
15	NC_017796	TCTTA	2	10	1816	1825	20 %	60 %	0 %	20 %	386858763
16	NC_017796	TACT	2	8	1836	1843	25 %	50 %	0 %	25 %	386858763
17	NC_017796	ATTAA	2	10	1856	1865	60 %	40 %	0 %	0 %	386858763
18	NC_017796	ATT	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858763
19	NC_017796	CTA	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858763
20	NC_017796	ACC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858763
21	NC_017796	CAT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858763
22	NC_017796	T	6	6	2096	2101	0 %	100 %	0 %	0 %	386858763
23	NC_017796	ATCA	2	8	2107	2114	50 %	25 %	0 %	25 %	386858763
24	NC_017796	CCT	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858763
25	NC_017796	AGCT	2	8	2146	2153	25 %	25 %	25 %	25 %	386858763
26	NC_017796	AGC	4	12	2167	2178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
27	NC_017796	CAG	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
28	NC_017796	CAG	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
29	NC_017796	CAG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
30	NC_017796	GCA	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
31	NC_017796	CAG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
32	NC_017796	TCACT	2	10	2418	2427	20 %	40 %	0 %	40 %	386858763
33	NC_017796	TAA	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858763
34	NC_017796	ATTTA	2	10	2500	2509	40 %	60 %	0 %	0 %	386858763
35	NC_017796	CAA	2	6	2628	2633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858764
36	NC_017796	A	6	6	2675	2680	100 %	0 %	0 %	0 %	386858764
37	NC_017796	T	6	6	2718	2723	0 %	100 %	0 %	0 %	386858764
38	NC_017796	TAT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858764
39	NC_017796	CAG	3	9	2740	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
40	NC_017796	T	6	6	2849	2854	0 %	100 %	0 %	0 %	386858764
41	NC_017796	CAC	2	6	2878	2883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858764
42	NC_017796	CTT	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858764
43	NC_017796	AGC	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
44	NC_017796	AAC	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858764
45	NC_017796	CAG	3	9	2983	2991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
46	NC_017796	ATC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858764
47	NC_017796	CAT	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858764
48	NC_017796	CTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858764
49	NC_017796	CTA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
50	NC_017796	CAA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858765
51	NC_017796	ATC	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
52	NC_017796	C	6	6	3193	3198	0 %	0 %	0 %	100 %	386858765
53	NC_017796	TAT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858765
54	NC_017796	TTCTT	2	10	3266	3275	0 %	80 %	0 %	20 %	386858765
55	NC_017796	ATC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
56	NC_017796	TTA	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858765
57	NC_017796	ATG	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858765
58	NC_017796	CCA	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858765
59	NC_017796	TC	3	6	3474	3479	0 %	50 %	0 %	50 %	386858765
60	NC_017796	TCC	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858765
61	NC_017796	CTC	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858765
62	NC_017796	CAC	4	12	3520	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858765
63	NC_017796	CAT	3	9	3532	3540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
64	NC_017796	ATC	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
65	NC_017796	ATC	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
66	NC_017796	TC	3	6	3570	3575	0 %	50 %	0 %	50 %	386858765
67	NC_017796	TTC	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858765
68	NC_017796	TATT	2	8	5245	5252	25 %	75 %	0 %	0 %	386858766
69	NC_017796	TAC	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
70	NC_017796	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
71	NC_017796	TTAATT	2	12	5302	5313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858766
72	NC_017796	CTT	2	6	5315	5320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858766
73	NC_017796	TCA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
74	NC_017796	ATT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858766
75	NC_017796	CTG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858766
76	NC_017796	GCA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
77	NC_017796	CAT	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
78	NC_017796	GCA	2	6	5437	5442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
79	NC_017796	CTC	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858766
80	NC_017796	TTG	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858766
81	NC_017796	CAC	2	6	5558	5563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858766
82	NC_017796	TGC	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858766
83	NC_017796	TAT	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858767
84	NC_017796	ATCA	2	8	5936	5943	50 %	25 %	0 %	25 %	386858767
85	NC_017796	CT	3	6	5970	5975	0 %	50 %	0 %	50 %	386858767
86	NC_017796	C	6	6	5979	5984	0 %	0 %	0 %	100 %	386858767
87	NC_017796	TTCTT	2	10	5994	6003	0 %	80 %	0 %	20 %	386858767
88	NC_017796	CAA	2	6	6016	6021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858767
89	NC_017796	TTA	2	6	6024	6029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858767
90	NC_017796	CT	3	6	6034	6039	0 %	50 %	0 %	50 %	386858767
91	NC_017796	ATTA	2	8	6680	6687	50 %	50 %	0 %	0 %	386858768
92	NC_017796	TC	3	6	6719	6724	0 %	50 %	0 %	50 %	386858768
93	NC_017796	TTC	2	6	6846	6851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
94	NC_017796	AGC	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
95	NC_017796	CCT	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858768
96	NC_017796	AGC	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
97	NC_017796	AT	3	6	7055	7060	50 %	50 %	0 %	0 %	386858768
98	NC_017796	CAC	2	6	7064	7069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858768
99	NC_017796	ACT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
100	NC_017796	TGC	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
101	NC_017796	CAG	2	6	7121	7126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
102	NC_017796	TAG	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858768
103	NC_017796	T	6	6	7204	7209	0 %	100 %	0 %	0 %	386858768
104	NC_017796	CTG	2	6	7268	7273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
105	NC_017796	TGC	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
106	NC_017796	CAG	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
107	NC_017796	CAT	2	6	7313	7318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
108	NC_017796	TGC	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
109	NC_017796	CTG	2	6	7352	7357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
110	NC_017796	TAA	2	6	7379	7384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858768
111	NC_017796	TTC	2	6	7423	7428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
112	NC_017796	ACTTT	2	10	7445	7454	20 %	60 %	0 %	20 %	386858768
113	NC_017796	AGT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858768
114	NC_017796	CTT	2	6	7506	7511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
115	NC_017796	CAT	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
116	NC_017796	TAC	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
117	NC_017796	CTT	2	6	7700	7705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
118	NC_017796	TC	3	6	7706	7711	0 %	50 %	0 %	50 %	386858768
119	NC_017796	TTC	2	6	7718	7723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
120	NC_017796	CCT	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858768
121	NC_017796	T	7	7	7735	7741	0 %	100 %	0 %	0 %	386858768
122	NC_017796	TC	3	6	7965	7970	0 %	50 %	0 %	50 %	386858769
123	NC_017796	TTC	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
124	NC_017796	TCC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858769
125	NC_017796	CCT	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858769
126	NC_017796	TCTT	2	8	8165	8172	0 %	75 %	0 %	25 %	386858769
127	NC_017796	CTT	2	6	8194	8199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
128	NC_017796	ATC	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858769
129	NC_017796	ATT	2	6	8263	8268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858769
130	NC_017796	TCT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
131	NC_017796	AT	3	6	8307	8312	50 %	50 %	0 %	0 %	386858769
132	NC_017796	TGC	4	12	8344	8355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858769
133	NC_017796	CTT	2	6	8361	8366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
134	NC_017796	CAT	2	6	8370	8375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858769
135	NC_017796	CCA	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858769
136	NC_017796	ACA	2	6	8465	8470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858769
137	NC_017796	CAA	2	6	8472	8477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858769
138	NC_017796	CAC	2	6	8553	8558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858769
139	NC_017796	GCT	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858769
140	NC_017796	CTC	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858769
141	NC_017796	CTTA	2	8	8614	8621	25 %	50 %	0 %	25 %	386858769
142	NC_017796	TAT	2	6	9238	9243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858770
143	NC_017796	TTA	2	6	9255	9260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858770
144	NC_017796	T	6	6	9272	9277	0 %	100 %	0 %	0 %	386858770
145	NC_017796	TTA	2	6	9288	9293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858770
146	NC_017796	CTT	2	6	9304	9309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858770
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148	NC_017796	A	6	6	9321	9326	100 %	0 %	0 %	0 %	386858770
149	NC_017796	TAC	2	6	9406	9411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858771
150	NC_017796	GCT	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
151	NC_017796	T	6	6	9443	9448	0 %	100 %	0 %	0 %	386858771
152	NC_017796	TCT	2	6	9493	9498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
153	NC_017796	TAA	2	6	9507	9512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858771
154	NC_017796	T	6	6	9536	9541	0 %	100 %	0 %	0 %	386858771
155	NC_017796	CTT	3	9	9545	9553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
156	NC_017796	TCC	2	6	9555	9560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858771
157	NC_017796	CTG	2	6	9572	9577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
158	NC_017796	CTG	2	6	9581	9586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
159	NC_017796	CTG	3	9	9635	9643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
160	NC_017796	TTTATC	2	12	9666	9677	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858771
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162	NC_017796	ACTTGC	2	12	9708	9719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386858771
163	NC_017796	TCT	2	6	9745	9750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
164	NC_017796	TGT	2	6	9792	9797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858771
165	NC_017796	GCC	2	6	9805	9810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858771
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167	NC_017796	CTG	2	6	9899	9904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
168	NC_017796	CTT	2	6	9932	9937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
169	NC_017796	CTA	2	6	9950	9955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858771
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171	NC_017796	GCC	2	6	10024	10029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858771
172	NC_017796	ACA	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858771
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176	NC_017796	CTG	2	6	10160	10165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858771
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178	NC_017796	TTC	2	6	10249	10254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858771
179	NC_017796	TAG	2	6	10256	10261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858771
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244	NC_017796	CAG	2	6	14963	14968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858777
245	NC_017796	TCA	2	6	14986	14991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858777
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247	NC_017796	CAA	2	6	15122	15127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858777
248	NC_017796	TTA	2	6	15130	15135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858777
249	NC_017796	ATG	2	6	15248	15253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858777
250	NC_017796	TTAC	2	8	15274	15281	25 %	50 %	0 %	25 %	386858777
251	NC_017796	TTC	2	6	15307	15312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858777
252	NC_017796	TCCTC	2	10	15316	15325	0 %	40 %	0 %	60 %	386858777
253	NC_017796	ACC	2	6	15358	15363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858777
254	NC_017796	ATC	2	6	15364	15369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858777
255	NC_017796	ATTGTC	2	12	15670	15681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386858778
256	NC_017796	TAA	3	9	15717	15725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858778
257	NC_017796	T	6	6	15870	15875	0 %	100 %	0 %	0 %	386858778
258	NC_017796	T	6	6	15878	15883	0 %	100 %	0 %	0 %	386858778
259	NC_017796	ATC	2	6	15912	15917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858778
260	NC_017796	AACT	2	8	16010	16017	50 %	25 %	0 %	25 %	386858779
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